采育地区原属古安次县,称采魏里。辽开泰元年(1012年),称采魏院,属析津府。辽太平六年(1026年),属南京道析津府。元至元十九年(1282年),属上林苑。二十一年,置大都路总管府,更名采魏里,属东安州。明洪武元年(1368年),大都路改为北平府。明永乐五年(1407年),上林苑改为上林苑监。明洪熙元年(1425年),以良牧、林衡二署并蕃育署。清康熙二十三年(1684年),定名采育延续至今。清乾隆三十二年(1767年),采育地区划归大兴县。1928年,大兴县划归河北省,采育属大兴县第二区。1930年,采育地区建采育镇。1948年12月,采育解放,属大兴县第九区,辖1镇、73村。1953年,采育地区为大兴县第五区,下设11乡。1956年,大兴县撤区并乡,采育乡辖27村,凤河营乡辖25村。1958年9月,采育地区成立采育人民公社,辖采育、青云店、长子营、凤河营、朱庄、大皮营等地区共2镇、112村。1961年4月,采育公社分为采育、青云店、长子营、凤河营4公社。1974年7月,采育公社析出朱庄、大皮营2公社。1983年7月,采育公社改乡。1990年2月,采育乡改镇。2000年3月,大皮营、凤河营2乡并入,采育镇辖55个村民委员会。